Nano Hash - криптовалюты, майнинг, программирование

Вопросы по теме 'bioinformatics'

Расщепление белка Regex
Итак, я расщепляю белковую последовательность с помощью фермента (для вашего любопытства, Asp-N), который расщепляет перед белками, кодируемыми B или D, в однобуквенной последовательности. Мой фактический анализ использует String#scan для захватов....
ruby regex bioinformatics
13.12.2023
Соедините 2 дерева с помощью Python (dendroPy или других библиотек)
Я работаю над филогениями, используя библиотеки Python (Bio.Phylo и DendroPy). Мне нужно импортировать 2 дерева в формате Newick (это, очевидно, не самая сложная часть) и соединить их вместе, точнее добавить одно дерево на один конец/лист другого....
python bioinformatics phylogeny
01.12.2023
Получение p-значений из исключений в R
У меня есть база данных из 96 наблюдений (пациентов) и 1098 переменных (генов). Ответ является двоичным (Y и N), а предикторы являются числовыми. Я пытаюсь выполнить перекрестную проверку с исключением одного, но меня интересует не стандартная...
r bioinformatics cross-validation
18.12.2023
Запрос генов в регионах
Я хочу получить гены, присутствующие в ряде регионов. Скажем, у меня есть файл кровати с такими позициями запроса, как: 1 2665697 4665777 MIR201 1 10391435 12391516 MIR500 1 15106831 17106911 MIR122 1...
r bioinformatics biomart bioconductor
09.12.2023
Как открыть и прочитать файл .gz в Nim (желательно построчно)
Я только что сел писать свой первый Nim скрипт для разбора файла .vcf (вариантный формат вызова). В этом формате файла хранятся генетические мутации из данных секвенирования. Что касается языков сценариев, я «вырос» на Perl , а затем перешел...
gzip bioinformatics nim-lang vcf-variant-call-format
27.12.2023
Функция FindVariableFeatures в Seurat, вызывающая ошибку в match(x, table, nomatch = 0L): 'match' требует векторных аргументов
Я запускаю Seurat V3 в RStudio и пытаюсь запустить PCA на новом подмножестве объекта. В рамках этого процесса я использую команды: tnk.cells <- FindVariableFeatures(tnk.cells, assay = "RNA", selection.method = "vst",...
r bioinformatics seurat
04.11.2023
R: применение критерия хи-квадрат Пирсона по двум столбцам
Я только начал кодировать на R, и у меня есть вопрос о применении теста хи-квадрат к набору данных по 2 столбцам за раз. Я хотел бы провести парный анализ (образцы опухоли и нормальной ткани взяты от одного пациента, поэтому первичная опухоль 1 и...
r bioinformatics statistics chi-squared
09.01.2024
Новые материалы
Кластеризация: более глубокий взгляд
Кластеризация — это метод обучения без учителя, в котором мы пытаемся найти группы в наборе данных на основе некоторых известных или неизвестных свойств, которые могут существовать. Независимо от..
Как написать эффективное резюме
Предложения по дизайну и макету, чтобы представить себя профессионально Вам не позвонили на собеседование после того, как вы несколько раз подали заявку на работу своей мечты? У вас может..
Частный метод Python: улучшение инкапсуляции и безопасности
Введение Python — универсальный и мощный язык программирования, известный своей простотой и удобством использования. Одной из ключевых особенностей, отличающих Python от других языков, является..
Как я автоматизирую тестирование с помощью Jest
Шутка для победы, когда дело касается автоматизации тестирования Одной очень важной частью разработки программного обеспечения является автоматизация тестирования, поскольку она создает..
Работа с векторными символическими архитектурами, часть 4 (искусственный интеллект)
Hyperseed: неконтролируемое обучение с векторными символическими архитектурами (arXiv) Автор: Евгений Осипов , Сачин Кахавала , Диланта Хапутантри , Тимал Кемпития , Дасвин Де Сильва ,..
Понимание расстояния Вассерштейна: мощная метрика в машинном обучении
В обширной области машинного обучения часто возникает необходимость сравнивать и измерять различия между распределениями вероятностей. Традиционные метрики расстояния, такие как евклидово..
Обеспечение масштабируемости LLM: облачный анализ с помощью AWS Fargate и Copilot
В динамичной области искусственного интеллекта все большее распространение получают модели больших языков (LLM). Они жизненно важны для различных приложений, таких как интеллектуальные..