Моя цель - отобразить R-скрипт в виде Rmarkdown pdf. Когда я пытаюсь отобразить Rscript, используя сначала yarnr::spin() для преобразования его в файл .Rmd, а затем rmarkdown::render для рендеринга файла rmd в pdf, я получаю сообщение об ошибке:
> rmarkdown::render("testcars.Rmd", "pdf_document")
processing file: testcars.Rmd
|.............................................. | 33%
ordinary text without R code
|............................................................................................ | 67%
label: unnamed-chunk-1
Quitting from lines 3-16 (testcars.spin.Rmd)
Error in sink(con, split = debug) : sink stack is full
Я получаю ту же ошибку, когда пытаюсь использовать rmarkdown::render() в файле .R.
Вот Rscript, который я пытался преобразовать в Rmarkdown PDF:
library(rmarkdown)
setwd("C:/myworkingdirectory")
data(cars)
str(cars)
summary(cars)
plot(cars)
hist(cars$speed)
boxplot(cars$dist)
knitr::spin(hair = "testcars.R", knit = F, format=c("Rmd"))
rmarkdown::render("testcars.Rmd", "pdf_document")