Nano Hash - криптовалюты, майнинг, программирование

Неустранимая ошибка после обновления до R 3.5.1 на сервере Ubuntu 18.04

После обновления R до версии 3.5.1 на сервере Ubuntu 18.04 я получил это сообщение об ошибке fatal error: unable to open the base package Я пытался удалить и переустановить пакет три раза, но все равно получаю ту же ошибку. Как я могу это исправить?

Это текущая версия R на моем сервере>>

IN: apt policy r-base

OUT: Installed: 3.5.1-1xenial
  Candidate: 3.5.1-1xenial
  Version table:
 * 3.5.1-1xenial 500
        500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/ Packages
        100 /var/lib/dpkg/status
     3.5.1-1bionic 500
        500 http://ppa.launchpad.net/marutter/rrutter3.5/ubuntu bionic/main amd64 Packages
     3.5.0-1xenial 500
        500 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/ Packages

Обновлено

После выполнения шагов от @duckmayr

это результат apt policy r-base

r-base:
  Installed: (none)
  Candidate: 3.5.1-1bionic
  Version table:
     3.5.1-1bionic 500
        500 http://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages
     3.5.0-1bionic 500
        500 http://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages
     3.4.4-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.3-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.2-2xenial2 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.2-1xenial1 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.1-2xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.1-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.4.0-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.3.3-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.3.2-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.3.1-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.3.0-2xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.3.0-1xenial0 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
     3.2.5-1xenial 500
        500 http://cran.wustl.edu/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages

и получить эту ошибку, когда я делаю sudo apt-get install r-base r-base-core

    Reading package lists... Done
    Building dependency tree
    Reading state information... Done
    Some packages could not be installed. This may mean that you have
    requested an impossible situation or if you are using the unstable
    distribution that some required packages have not yet been created
    or been moved out of Incoming.
    The following information may help to resolve the situation:

    The following packages have unmet dependencies:
 r-base : Depends: r-recommended (= 3.5.1-1bionic) but it is not going to be installed
 r-base-core : Depends: zip but it is not installable
               Depends: unzip but it is not installable
               Depends: libpaper-utils but it is not installable
               Depends: libcurl4 (>= 7.28.0) but it is not installable
               Depends: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0) but it is not installable
               Depends: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) but it is not installable
               Depends: libtcl8.6 (>= 8.6.0) but it is not installable
               Depends: libtiff5 (>= 4.0.3) but it is not going to be installed
               Depends: libtk8.6 (>= 8.6.0) but it is not installable
               Recommends: r-recommended but it is not going to be installed
               Recommends: r-base-dev but it is not going to be installed
E: Unable to correct problems, you have held broken packages.

и получить это при попытке sudo apt install libcurl4-gnutls-dev libxml2-dev libssl-dev

 Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
libcurl4-gnutls-dev is already the newest version (7.58.0-2ubuntu3.3).
Some packages could not be installed. This may mean that you have
requested an impossible situation or if you are using the unstable
distribution that some required packages have not yet been created
or been moved out of Incoming.
The following information may help to resolve the situation:

The following packages have unmet dependencies:
 libssl-dev : Depends: libssl1.0.0 (= 1.0.2g-1ubuntu4.13) but 1.0.2n-1ubuntu5.1 is to be installed
              Recommends: libssl-doc but it is not going to be installed
 libxml2-dev : Depends: libxml2 (= 2.9.3+dfsg1-1ubuntu0.6) but 2.9.4+dfsg1-6.1ubuntu1.2 is to be installed
E: Unable to correct problems, you have held broken packages.
ubuntu-18.04 r ubuntu apt
24.09.2018

  • Из вывода apt policy я вижу, что вы установили пакет Xenial, а не пакет Bionic; почему это? У вас возникли проблемы с установкой пакета Bionic? 24.09.2018
  • да, я пытался установить пакет bionic, но столкнулся с проблемой установки пакетов R, поэтому я попытался установить R, используя следующие команды: sudo add-apt-repository 'deb cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/' sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9 sudo apt update. Sudo apt-get установить r-base 24.09.2018
  • Я опубликую ответ, который может решить вашу проблему; пожалуйста, дайте мне знать, если это работает или нет! 24.09.2018
  • Что возвращает which R? 24.09.2018
  • Как мне удалить всю версию R с моего сервера, теперь после последней пробной версии осталось 4 версии R ( 3.5.1-1xenial 500, 3.5.1-1bionic 500, 3.5.0-1xenial 500, 3.5.0-1bionic 500) 25.09.2018
  • Похоже, что версий R на самом деле нет — в выводе apt policy код приоритета 500 означает возможность установки, а один из 100 означает установленный (см. man apt_preferences или этот вопрос по Unix и Linux); поскольку ни один из них не указан как 100, похоже, что ни один из них не установлен. Это на самом деле указывает мне на упущение в моем ответе; пожалуйста, ознакомьтесь с новыми правками (скоро появятся). 25.09.2018
  • Хорошо, спасибо за ваши усилия, ценю это. 25.09.2018
  • @duckmayr Я попробовал шаги из вашего ответа и обновил вопрос после получения новых ошибок. 25.09.2018
  • @ omarahmedm93 Вы удаляли системные файлы вручную? 26.09.2018
  • @Believer после удаления старого R с помощью sudo apt purge r-base я столкнулся с проблемой установки пакетов R, поэтому я удалил libpaths и все каталоги R com из which R 26.09.2018

Ответы:


1

Похоже, у вас установлен пакет Xenial (Ubuntu 16.04) для R 3.5.1, поэтому он может решить вашу проблему с установкой версии Bionic (Ubuntu 18.04). У меня есть ответ здесь, демонстрирующий обновление до R 3.5.x в Linux Mint 19, и, как я объясняю, здесь, инструкции работают и для Ubuntu 18.04 (поскольку Mint основан на Ubuntu) ; У меня есть несколько машин с Mint 19 и несколько с Ubuntu 18.04, и я использую один и тот же процесс для обоих. Тем не менее, похоже, это не совсем дубликат, поскольку вам нужно выполнить некоторую очистку, прежде чем следовать правильному процессу установки, и некоторые шаги, которые вы можете пропустить. Вот что я бы сделал:

1. Удалите текущую установку R

Вы можете сделать это через

sudo apt purge r-base

Или, если у вас также есть r-base-dev

sudo apt purge r-base r-base-dev

2. Удалите ошибочные репозитории

Вы добавили следующие репозитории:

  1. ppa:marutter/rrutter3.5
  2. https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/

Вы должны иметь возможность удалить их через

sudo apt-add-repository --remove ppa:marutter/rrutter3.5
sudo apt-add-repository --remove 'deb cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/'

3. Установите пакет Bionic для R 3.5.1.

Это следует моему руководству, указанному выше, но пропускает шаг добавления доверенного ключа, поскольку вы уже это сделали; вы должны быть в порядке, если вы выполните следующее:

sudo echo "deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list
sudo apt update
sudo apt install r-base r-base-dev

Обратите также внимание, что я поставил для установки r-base и r-base-dev, но я не знаю, хотите ли вы r-base-dev. Я очень рекомендую это.

Затем вы сможете запустить новый сеанс R, где вы можете запустить

update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)

чтобы убедиться, что у вас есть все ранее установленные пакеты R.

24.09.2018
  • Я получил ту же ошибку, когда пытаюсь запустить сеанс R. 24.09.2018
  • @ omarahmedm93 Спасибо за обновление, будем разбираться дальше. 24.09.2018
  • Спасибо за старания, ценю :) 24.09.2018
  • @ omarahmedm93 omarahmedm93 кажется, этот ответ не решил вашу проблему, но помечен как правильный ответ. Я предлагаю снять «галочку» до тех пор, пока не будет опубликован правильный ответ, который мне также нужен для той же проблемы. 09.10.2018
  • @kbrand Да, я не решил свою проблему, отключил свой сервер и создал новый экземпляр, я принял утиный ответ, чтобы поблагодарить его за помощь. 11.10.2018
    • Новые материалы
    Кластеризация: более глубокий взгляд
    Кластеризация — это метод обучения без учителя, в котором мы пытаемся найти группы в наборе данных на основе некоторых известных или неизвестных свойств, которые могут существовать. Независимо от..
    Как написать эффективное резюме
    Предложения по дизайну и макету, чтобы представить себя профессионально Вам не позвонили на собеседование после того, как вы несколько раз подали заявку на работу своей мечты? У вас может..
    Частный метод Python: улучшение инкапсуляции и безопасности
    Введение Python — универсальный и мощный язык программирования, известный своей простотой и удобством использования. Одной из ключевых особенностей, отличающих Python от других языков, является..
    Как я автоматизирую тестирование с помощью Jest
    Шутка для победы, когда дело касается автоматизации тестирования Одной очень важной частью разработки программного обеспечения является автоматизация тестирования, поскольку она создает..
    Работа с векторными символическими архитектурами, часть 4 (искусственный интеллект)
    Hyperseed: неконтролируемое обучение с векторными символическими архитектурами (arXiv) Автор: Евгений Осипов , Сачин Кахавала , Диланта Хапутантри , Тимал Кемпития , Дасвин Де Сильва ,..
    Понимание расстояния Вассерштейна: мощная метрика в машинном обучении
    В обширной области машинного обучения часто возникает необходимость сравнивать и измерять различия между распределениями вероятностей. Традиционные метрики расстояния, такие как евклидово..
    Обеспечение масштабируемости LLM: облачный анализ с помощью AWS Fargate и Copilot
    В динамичной области искусственного интеллекта все большее распространение получают модели больших языков (LLM). Они жизненно важны для различных приложений, таких как интеллектуальные..