Как с помощью этого кода можно сопоставить «abteam» с «ab»?
agrep("abteam",c("acb","abd","ab"),value=T,ignore.case = TRUE,max = list(del = 10, ins = 10, sub = 10))
Результат character(0), хотя я указал del=10, ins=10. В чем проблема? Как работает agrep?
Из файла справки:
Если «стоимость» не указана, «все» по умолчанию равно 10%, а другие границы числа преобразований по умолчанию равны «всем».
Насколько я понимаю, это означает, что либо cost, либо all является ограничивающим фактором, даже если вы установите del, ins и sub. Если вы хотите разрешить 10 преобразований, вы можете просто установить max = 10. Дополнительные параметры могут использоваться для ограничения определенных преобразований, например:
> x <- c("fooar","ooar","foobaz")
> agrep("foobar", x, value=T, max = list(all = 3, del = 0, ins = 0))
[1] "foobaz"
В вашем случае вы можете использовать max = list(all = 10 ,del = 10, ins = 10, sub = 10)).
agrep(pat, x, value=T, max = list(all = 10 ,del = 10, ins = 0, sub = 10)), ничего не возвращается. Это не имеет смысла — 4 удаления, больше ничего и"abteam"соответствует"ab". 24.06.2015import tre; fz=tre.Fuzzyness(maxerr=10, maxdel=10, maxins=0, maxsub=10); pt=tre.compile("abteam"); pt.search("ab", fz). 24.06.2015agrepнастолько сбивает меня с толку, что в прошлом я обычно использовал вместо этогоadist- по крайней мере, это дает хорошие четкие значения, которые я могу протестировать. 24.06.2015adistдовольно мило. Другой альтернативой является библиотека Biostrings. 25.06.2015