Nano Hash - криптовалюты, майнинг, программирование

Перебор всех входов в каталоге и создание выходных каталогов с входным именем

У меня есть каталог с 10 разными файлами, и мне нужно запустить одну и ту же команду для всех файлов, но сохранить результаты в отдельных каталогах, которые уникальны с моими именами входных файлов в качестве имени каталогов результатов. Я понимаю, что мой вопрос похож на циклический просмотр всех входы и создание отдельных выходных файлов, поэтому я попробовал следующий код:

cd /user/test

for i in *.txt
do 
   fastqc $i -o {$i}.out
done

Я получаю сообщение об ошибке:

Specified output directory '{1.txt}.out' does not exist
Specified output directory '{2.txt}.out' does not exist

Мне было интересно, в чем может быть проблема, так как это было бы полезно при создании конвейеров и рабочих процессов. Спасибо!

bash loops
05.12.2014

Ответы:


1

Мне нравится использовать find, который полезен, если ваши файлы находятся во вложенных каталогах:

find /user/test -name '*.txt' -exec fastqc "{}" -o "{}.out" \;

find выполнит команду, указанную после -exec, для всех файлов .txt, найденных в /user/test (поиск рекурсивный).

07.12.2014

2

У вас есть { и } снаружи, вам нужно использовать:

cd /user/test    
for i in *.txt; do
   fastqc "$i" -o "${i}.out"
done

Или просто:

for i in *.txt; do
   fastqc "$i" -o "$i.out"
done

Поскольку DOT не считается частью имени переменной.

05.12.2014
Новые материалы
Кластеризация: более глубокий взгляд
Кластеризация — это метод обучения без учителя, в котором мы пытаемся найти группы в наборе данных на основе некоторых известных или неизвестных свойств, которые могут существовать. Независимо от..
Как написать эффективное резюме
Предложения по дизайну и макету, чтобы представить себя профессионально Вам не позвонили на собеседование после того, как вы несколько раз подали заявку на работу своей мечты? У вас может..
Частный метод Python: улучшение инкапсуляции и безопасности
Введение Python — универсальный и мощный язык программирования, известный своей простотой и удобством использования. Одной из ключевых особенностей, отличающих Python от других языков, является..
Как я автоматизирую тестирование с помощью Jest
Шутка для победы, когда дело касается автоматизации тестирования Одной очень важной частью разработки программного обеспечения является автоматизация тестирования, поскольку она создает..
Работа с векторными символическими архитектурами, часть 4 (искусственный интеллект)
Hyperseed: неконтролируемое обучение с векторными символическими архитектурами (arXiv) Автор: Евгений Осипов , Сачин Кахавала , Диланта Хапутантри , Тимал Кемпития , Дасвин Де Сильва ,..
Понимание расстояния Вассерштейна: мощная метрика в машинном обучении
В обширной области машинного обучения часто возникает необходимость сравнивать и измерять различия между распределениями вероятностей. Традиционные метрики расстояния, такие как евклидово..
Обеспечение масштабируемости LLM: облачный анализ с помощью AWS Fargate и Copilot
В динамичной области искусственного интеллекта все большее распространение получают модели больших языков (LLM). Они жизненно важны для различных приложений, таких как интеллектуальные..