Вы можете установить заголовки кэша:

<?php
header('Content-Type: application/javascript');
header("Cache-Control: max-age=29030400");
header("Cache-Control: public", false); 
$js_output = array('something' => 'some value');
?>
var <?=json_encode($js_output)?>

см. также: http://php.net/manual/en/function.header.php< /а>

Вам нужно сохранить почти те же настройки Expire в вашем .htaccess, то есть:

ExpiresActive on
ExpiresByType image/gif A29030400
ExpiresByType image/jpeg A29030400
ExpiresByType image/png A29030400
ExpiresByType text/css A29030400
ExpiresByType application/javascript A29030400
ExpiresDefault "access plus 1 month"

Затем в вашем PHP-коде, который пишет файл JS, используйте правильные Content-Type и :

<?php
header('Content-Type: application/javascript');
exitIfNotModifiedSince(setLastModified());

function setLastModified($lastModified=NULL) {
    $pageModified = getlastmod();

    if(empty($lastModified) || ($lastModified < $pageModified))
        $lastModified = $pageModified;
    $headerModified = filemtime(__FILE__);
    if($headerModified > $lastModified)
        $lastModified = $headerModified;
    header('Last-Modified: ' . date("r",$lastModified));
    return $lastModified;
}

function exitIfNotModifiedSince($lastModified) {
    if(array_key_exists("HTTP_IF_MODIFIED_SINCE",$_SERVER)) {
        $ifModifiedSince = strtotime(preg_replace('/;.*$/', '',
                                     $_SERVER["HTTP_IF_MODIFIED_SINCE"]));
        if($ifModifiedSince >= $lastModified) { 
            header("HTTP/1.0 304 Not Modified");
            exit();
        }
    }
}
$jsData  = array('foo' => 'bar');
?>
var <?=json_encode( $jsData );?>

наверху. Следите за своими заголовками в Firebug, и он должен показать вам что-то вроде этого:

HTTP/1.1 304 Not Modified
Cache-Control:max-age=29030400
Connection:close
Date:Wed, 24 Oct 2012 19:10:43 GMT
Expires:Wed, 25 Sep 2013 19:10:43 GMT
Server:Apache/2.2.9 (Unix) mod_ssl/2.2.9 OpenSSL/0.9.8h DAV/2 PHP/5.2.6
Content-Length: 31
Content-Type: application/javascript

Это решение вернет правильный ответ 304 и остановит выполнение php, позволяя клиенту использовать кешированную копию. Вы не можете сделать это полностью в htaccess, используя mod_rewrite, так как процессор php всегда будет мешать.

.htaccess

<IfModule mod_expires.c>
    ExpiresActive on
    ExpiresByType application/javascript   "access plus 1 year"
</IfModule>
<IfModule mod_headers.c>
    Header append Cache-Control "public"
</IfModule>

пример.js.php

<?php
header('Content-Type: application/javascript');

if (false === ($timestamp = getlastmod())) {
    if (false === ($timestamp = @filemtime(__FILE__))) {
        if (false === ($timestamp = @filemtime($_SERVER['SCRIPT_FILENAME']))) {
            trigger_error('Failed to retrieve timestamp', E_USER_ERROR);
        }
    }
}
$timestamp_string = gmdate('r', $timestamp);

// Check if the client has the same page cached
if (isset($_SERVER["HTTP_IF_MODIFIED_SINCE"]) &&
    ($_SERVER["HTTP_IF_MODIFIED_SINCE"] == $timestamp_string)) {
    header("HTTP/1.1 304 Not Modified");
    exit;
}

// Inform the user agent what is our last modification date
header("Last-Modified: ".$timestamp_string);

$js_output = array('something' => 'some value');
echo 'var json = '.json_encode($js_output).PHP_EOL;
exit;
?>

Первый ответ GET

HTTP/1.1 200 OK
Date: Wed, 24 Oct 2012 16:20:05 GMT
Server: Apache/2.2.16 (Win32) PHP/5.3.3
X-Powered-By: PHP/5.3.3
Last-Modified: Wed, 24 Oct 2012 16:16:34 GMT
Cache-Control: max-age=31536000
Expires: Thu, 24 Oct 2013 16:20:05 GMT
Content-Length: 39
Keep-Alive: timeout=5, max=100
Connection: Keep-Alive
Content-Type: application/javascript

Второй и последующие ответы GET

HTTP/1.1 304 Not Modified
Date: Wed, 24 Oct 2012 16:21:31 GMT
Server: Apache/2.2.16 (Win32) PHP/5.3.3
Connection: Keep-Alive
Keep-Alive: timeout=5, max=100
Expires: Thu, 24 Oct 2013 16:21:31 GMT
Cache-Control: max-age=31536000